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PCR原料的處理工藝有哪些

日期:2025-08-28 閱讀量:

一、核酸提取的核心方法

  1. 酚-氯仿抽提法
    • 原理:利用裂解液破壞細(xì)胞釋放核酸,通過酚-氯仿去除蛋白質(zhì),乙醇沉淀DNA。
    • 特點(diǎn)
      • 優(yōu)點(diǎn):核酸純度高,可同時(shí)分離DNA和RNA。
      • 缺點(diǎn):操作繁瑣,使用有毒試劑(苯酚、氯仿),RNA易降解,對操作要求高。
    • 適用場景:對純度要求極高的實(shí)驗(yàn)(如基因克隆、測序)。
  2. 柱式提取法
    • 原理:核酸在高鹽條件下結(jié)合硅膠膜,雜質(zhì)被洗脫,最后用低鹽緩沖液洗脫核酸。
    • 特點(diǎn)
      • 優(yōu)點(diǎn):操作簡便快速,純度高,適合PCR、qPCR等下游應(yīng)用,安全性高(無毒試劑)。
      • 缺點(diǎn):對低DNA濃度樣本回收率可能較低。
    • 適用場景:常規(guī)樣本(如血液、組織)的快速提取。
  3. 磁珠法
    • 原理:表面修飾的磁性微珠與核酸結(jié)合,通過磁場分離雜質(zhì),最后洗脫核酸。
    • 特點(diǎn)
      • 優(yōu)點(diǎn):高通量、自動化兼容性強(qiáng),適合大規(guī)模樣本處理,純度好,適合高靈敏度檢測。
      • 缺點(diǎn):試劑成本較高。
    • 適用場景:臨床診斷、高通量測序等需要大規(guī)模處理的場景。

二、樣本處理與核酸純化關(guān)鍵步驟

  1. 樣本采集與裂解
    • 采集:根據(jù)樣本類型(血液、組織、細(xì)胞等)選擇合適方法(如抗凝管采血、無菌拭子采集)。
    • 裂解:使用裂解液(含蛋白酶K、SDS等)破壞細(xì)胞或病毒,釋放核酸。
  2. 結(jié)合與洗滌
    • 結(jié)合:加入乙醇后,將混合物加載到核酸純化柱或磁珠中,核酸結(jié)合到硅膠膜或磁珠表面。
    • 洗滌:用洗滌緩沖液去除蛋白質(zhì)、鹽類、有機(jī)溶劑等雜質(zhì)。
  3. 洗脫與保存
    • 洗脫:用低鹽緩沖液(如ddH?O或TE)洗脫核酸,得到純凈DNA/RNA。
    • 保存:避免反復(fù)凍融,防止核酸降解(如RNA需-80℃保存)。

三、質(zhì)量控制與優(yōu)化

  1. 避免污染
    • 使用無核酸酶的試劑和耗材,操作時(shí)戴手套、口罩,避免說話、咳嗽。
    • 設(shè)置陰性對照(如無模板對照)監(jiān)測污染。
  2. 保證核酸完整性
    • 提取RNA時(shí)避免RNase污染,操作輕柔,避免劇烈震蕩。
    • 使用DNase I處理樣本中的基因組DNA(如提取RNA時(shí))。
  3. 優(yōu)化提取條件
    • 根據(jù)樣本類型和實(shí)驗(yàn)需求選擇合適方法(如低DNA含量樣本優(yōu)先選磁珠法)。
    • 調(diào)整裂解時(shí)間、洗滌次數(shù)等參數(shù)以提高回收率和純度。
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